影响贮存中茉莉花茶品质变化的因素，主要为温度、含水量、氧气和光线，在一般情况下影响最大的是茶叶含水量。其次为温度和氧气，而光线则比较容易控制。一般茶叶成品出厂水分含量，最好能保持在5%以下，则品质变化较慢。茉莉花茶成品茶出厂水分含量多接近8%。因而对湿度更加敏感，而周围环境的相对而言湿度直接影响茶叶的吸湿速度。所以散装茉莉花茶最好贮存在低温干燥的仓库中。比较理想的条件是温度在5度以下，相对温度为50%左右。但在具体实施中还必须结合经济效果来考虑而采取略高的温度。
氧气能促进花茶变质。因此无论大小包装均要装紧装实，尽量减少容器中的空隙以减少茶叶与氧气的接触。为了达到更好地保护成品品质的目的，在条件许可的情况下，应考虑采取抽气充氮密封包装。
散装茶在贮存中还须注意对装箱不满一箱的堆尾茶的及时处理。因为堆尾茶箱内空隙大，氧气多，对茶汤的色泽和滋味影响极大。而且容易引起茶叶中脂质的过氧化而变陈甚至变质。
茉莉花茶在零售门市的贮存因包装物有时已经拆开而必须更好重视。一般不要随便开箱。如有必要，也应随开随封，以防香气逸失和茶叶回潮。